Кузнецк. Изображение города, относящееся к концу XVII в. (по Ремезову)
Однако строительство городов и расцвет их архитектуры отнюдь не означали цветущего состояния всей русской экономики и культуры. Отрицательные последствия татарского ига еще продолжали ощущаться, а закрепощение крестьян, завершенное указами 1586 и 1597 гг., легло тяжелым бременем на феодальную деревню. Крепостное право еще более усилило противоречия между городом и деревней, обрекая деревню на отсталось и подневольный труд и давая возможность городу развиваться за счет деревни. Крестьянство ответило на закрепощение стихийными восстаниями, из которых самое крупное под руководством Ивана Болотникова вылилось в крестьянскую войну.
Крестьянская война, охватившая весь юго-запад страны вплоть до самой Москвы, и польско-шведская интервенция так называемого "смутного времени" расшатали экономику русского города. Ряд городов и в том числе Москва, Тула, Калуга, Новгород, Смоленск и др. стали ареной ожесточенных боев. В огне пожаров погибла большая часть деревянной застройки Москвы, Тульский кремль был затоплен по приказу Василия Шуйского, а героически оборонявшаяся Троице-Сергиева лавра была наполовину разрушепа поляками. Именно поэтому два первых десятилетия после изгнания интервентов нижегородским ополчением Минина и Пожарского стали периодом восстановительного строительства. В 1620 г. восстанавливаются стены Новгорода и Твери, в 1630 г. строятся каменные стены в Вязьме и Можайске, в 1631 г. производится капитальный ремонт укреплений Переславля-Залесского, а в 1637-1640 гг. сооружаются новые стены московского Скородума. Восстановительное строительство, начатое в 20-х годах XVII столетия, переросло по мере укрепления экономики страны в строительство новых городов, и к 1653 г. на территории Российского государства появилось не менее 45 новых укрепленных пунктов. Непрерывно продолжавшееся освоение Сибири послужило причиной оснований Тарска, Кузнецка, Красноярска, Верхоянска, Якутского острога, и к началу XVIII в. цепь городов растянулась до побережья Охотского и Берингова морей. Одновременно со строительством сибирских городов, следуя за продвигавшимися южными "засеками" и валами, возникали города на Дону, в верховьях Оки и на Волге.
В 1654 г. в результате воссоединения Украины и России возвратилась в лоно русской государственности древнейшая столица Руси - Киев.
Следует отметить, что процессы экономического и общественного развития русских городов, проявившие себя еще в XV и XVI вв., теперь достигли яркого выражения. С образованием единого всероссийского рынка усилилось значение купечества. Наряду с купечеством выросло влияние ремесленной верхушки, но, разумеется, самой сильной социальной прослойкой стало дворянство, державшее в своих руках и войско, и администра-тивное управление, и многочисленные поместья, перешедшие к дворянам от бывших удельных князей и бояр. "Соборное уложение" 1649 г. подвело итог ликвидации феодальных пережитков упразднением "белых слобод" и переводом слободской земли на московского государя. Отныне древнерусский город, возникавший и развивавшийся по воле феодалов, не зависимых от центральной власти, уходит в невозвратимое прошлое.